FinalCodeのオプション契約機能となります「API」と組み合わせることで対応できます。

• 共有フォルダー自動暗号化の仕組み。
  
  ファイルシステムのログを元にファイルの変更を検知して暗号化する。
• Linuxにも、ディレクトリ監視コマンド（incronコマンド）があり、それでディレクトリへのファイル追加を検知可能です。
  これをトリガーにFinalCodeのAPIで暗号化を行うことが可能です。